• Đối tượng tham dự và chia bảng:

Gồm 16 đội tham dự, Bqn tổ chức giải chia thành 3 bảng theo khu vực địa lý như sau:

• • Bảng A: Bảng trưởng Nghệ An, gồm 6 đội: Sara Nghệ An, Quân khu 2, Vĩnh Phúc, Quảng Bình, Yên Bái, Thanh Thái.
  • Bảng B: Bảng trưởng Quảng Ngãi, gồm 5 đội: Quảng Ngãi, Kon Tum, Phú Yên, Bình Định, Đà Nẵng.
  • Bảng C: Bảng trưởng Cà Mau gồm 5 đội: Cà Mau, Quân khu 9, TT. Thành Long, Đồng Nai, Bình Thuận.
• Phương thức thi đấu:
  • Các đội bóng thi đấu theo thể thức vòng tròn 1 lượt, tính điểm xếp hạng ở mỗi bảng.
  • 4 đội bóng sẽ được thi đấu ở giải bóng đá Hạng nhì năm 2006:
  • 3 đội xếp thứ nhất ở mỗi bảng
  • 1 đội xếp thứ nhì có số điểm và các chỉ số phụ cao nhất ở ba bảng. (trường hợp số lượng các đội bóng ở ba bảng không bằng nhau thì Ban tổ chức giải sẽ có thông báo về phương thức để lựa chọn 2 đội còn lại được thăng hạng mùa bóng 2006).
• Cách tính điểm, xếp hạng:
  • Đội thắng: 3 điểm
  • Đội hoà: 1 điểm
  • Đội thua: 0 điểm
  • Tính tổng số điểm của các đội đạt được để xếp thứ hạng trong từng bảng.
  • Nếu có từ hai đội trở lên bằng điểm nhau, trước hết tính kết quả của các trận đấu giữa các đội đó với nhau theo thứ tự:
    • Tổng số điểm
    • Hiệu số của số bàn thắng trừ bàn thua
    • Tổng số bàn thắng

Đội nào có chỉ số cao hơn sẽ xếp trên, nếu vẫn bằng nhau sẽ tổ chức bốc thăm.

• Quy định trận đấu:
  • Mỗi trận đấu gồm 2 hiệp, mỗi hiệp 45 phút, giữa 2 hiệp nghỉ 15 phút.
  • Mỗi đội bóng được quyền đăng ký tối đa 7 cầu thủ dự bị và được phép thay thế tối đa 3 cầu thủ trong mỗi trận đấu.
• Giải thưởng:

Đội xếp thứ nhất của mỗi bảng: Cờ, giải thưởng và 10.000.000 đ/đội.[3]